1、长期使用农药，病虫害、杂草抗药性增强，防治难度增大。稗草是最难防除的一种杂草，种类多，近年来最突出的当属“青稗”，已对双草醚、五氟磺草胺等除草剂产生不同的抗性，如果不及时施用有针对性的除草剂，将会给稗草的防治造成更大的难度。

2、普遍缺乏科学用药方法农药的不同种类，用药数量、施用方法、防治次数均将在稻田中产生不同程度的残留。由于农民对农药性质和种类知识缺乏了解，所以在选择时随意性很大，做不到对症下药，使用方法也是处于初级阶段，离科学使用还相差甚远。有不少稻农误认为加大剂量就会提高防治效果，甚至有的比说明书规定标准高出2-3倍的用量使用，一则使禾苗受到不同程度的伤害，二则造成过量农药在土壤中的大量残留，对地下水造成长期污染。来源：中国农药网